２２世紀初頭、人類は地球に科学の大樹『軌道エレベーター』を植えた――。利権、栄光、各国の思惑渦巻いたサミットのさなか、不意に現れた老人によって世界に再び錬金術が現れる。それから十数年、錬金術アカデミーを志した少女と一人の少年の出会いが、〝フラスコ〟の中で化学反応を呼ぶ。これは、少しだけ異なった世界の少しだけ先の未来を生きるモノ達が、夜明けを迎えに行くお話。