遺伝子改造技術が発達し、恵まれた層の人々は次々と自分の子供の遺伝子を優秀なものへと改造していた。やがて、遺伝子改造された者たちは社会の上位層を占め、世界は優秀な遺伝子改造人間と社会的弱者となった純人間に分けられる。そんな二極化された世界において純人間の存亡を望むジル・ロルマン博士はナイトと呼ばれる頭にBrain Machine Device(BMD)を埋め込むことで、あらゆる機械を操れる者達と共に遺伝子改造人間に対して抵抗を開始する。博士によって遺伝子改造人間でありながらもナイトの仲間に強引にされたセリザワ・カクは十三番目のナイトとして分裂する世界で統一の道を目指す。やがて彼は仮面の王【KING OF MASK】と呼ばれるようになるのだった。